導致牙周病的原因，可以分為局部因素和全身因素。
①局部因素中，牙菌斑、細菌及其產物是引發牙周病的主要原因。口腔衛生不良，微生物的作用，牙結石刺激，尤其是牙齦下結石危害性最大。菌斑是指黏附於牙齒表面的微生物群，不能通過漱口、水沖洗等被去除，是牙周病的主要致病因素。
牙結石是沉積在牙面上的礦化的菌斑，牙結石又根據其沉積部位和性質分為齦上牙石和齦下牙石兩種。齦上牙石位於齦緣以上的牙面上，肉眼可直接看到。在牙頸部沉積較多，特別在大涎腺導管開口相對處，如上頜磨牙的頰側和下頜前牙的舌側沉積更多。齦上牙石中無機鹽的主要來源是唾液中的鈣、磷等。齦下牙石位於齦緣以下、齦袋或牙周袋內的根面上，肉眼不能直接看到，須用牙周專科工具檢查。齦下牙石主要是齦溝液和滲出物提供鹽。牙石對牙周組織的危害，主要是它構成了菌斑附著和細菌孳生的良好環境。一塊1立方毫米大小的牙結石可以存在上億的有害細菌。牙石妨礙了口腔衛生的維護，從而加速了菌斑的形成，對牙齦組織形成刺激。
如果咬稔力過大或方向異常，超越了牙周組織的承受的力，致使牙周組織發生損傷的咬胎，稱為創傷性咬胎。創傷性咬貂包括咬胎時的早接觸、貂干擾、夜間磨牙等。
由於牙齒磨耗，或者補牙後、鑲牙後咬胎關係沒有調整至正常，出現咬貂高點，使全口的咬矜力量集中在某一個牙、某一個點，就會對這個部位的牙周組織造成很大的創傷。牙周膜結構的特點決定了牙周組織最善於承受自牙冠向牙根尖的縱向力量，最不善於承受橫向力量。當有咬貂干擾的情況發生時，側向給力過大，就會對牙周組織造成創傷；夜間磨牙對牙體牙周都有很大的、持續的損害。
其他局部因素還包括食物嵌塞、不良修復物、張口呼吸等因素也會使牙周組織發炎。另外，假牙清潔方法不當、不徹底，很容易產生異味、牙石、菌斑，也會引發牙周病。如果再加上假牙鬆動，則會導致咀嚼疼痛，直接影響飲食、降低腸胃功能，甚至可能導致口腔癌及內臟疾病，後果非常嚴重。
②牙周病的發生，局部因素是主要的。全身因素也可以降低或改變牙周組織對外來刺激的抵抗力，使之易於患病，並會加重加快齦炎和牙周炎的發展。全身因素與營養代謝障礙、內分泌紊亂、自主神經功能紊亂等有關，主要包括內分泌失調，如性激素、腎上腺皮質激素、甲狀腺素等的分泌異常；飲食和營養不均衡，如維生素C、維生素D、鈣、磷的缺乏或不平衡，營養不良等。血液病與牙周組織的關係極為密切，白血病患者常出現牙齦腫脹、潰瘍、出血等。血友病可發生牙齦自發性出血等。某些藥物的長期服用，如苯妥英鈉可使牙齦發生纖維性增生。某些類型的牙周病，如青少年牙周炎，患者往往有家族史，因而考慮有遺傳因素。
還有一些口腔疾病也被認為與遺傳因素有關，然而筆者認為，與其把它理解為基因的遺傳，不如把它理解成生活習慣的遺傳。因為這些疾病的臨床表現的確帶有很大家族性特點，同時，這些家族在生活習慣、口腔衛生習慣、對生活品質的態度，以及對於健康的認知等方面，也表現出很大程度上的一致性。
總之，牙周病的病因比較複雜，在治療時不僅要注意局部因素的消除，也要考慮到全身的狀態，以便獲得較好的治療效果。
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