牙周病對全身很多疾病都有影響，常見的有以下情況。
(1) 心腦血管系統:牙周感染引起急性或亞急性感染性心內膜炎是最為明顯和肯定的例子。由於存在風濕性或先天性心臟瓣膜病損或植入人工瓣膜，當出現暫時性菌血症時，可使機體產生迴圈抗體凝聚素，使血小板凝集形成血栓，病原菌黏附其上，從而引發心內膜炎。
(2) 早產和低出生體重兒:傳統觀點認為，孕婦的細菌性陰道炎病是早產的主要因素，但有25%的早產兒、低出生體重兒未能發現傳統的原因。據報告顯示，患重症牙周炎的孕婦發生低出生體重兒的危險為牙周正常孕婦的7.5倍。在早產婦的羊水中能檢測到口腔內常見的核梭桿菌。
(3) 消化道疾病：幽門螺桿菌是慢性胃炎、胃潰瘍甚至胃癌的致病菌的觀點已得到證實。近年來，關於牙菌斑是否為幽門螺桿菌的“儲備庫”的研究已引起重視，不少研究者在牙菌斑和唾液中檢査出幽門螺桿菌。牙周炎患者的菌斑中幽門螺桿菌的檢出率高於牙周健康者和胃炎組，齦下菌斑中的檢出率高於齦上菌斑。
(4) 呼吸道疾病:流行病學調査結果，經多因素分析校準了年齡、性別、種族、吸煙、婚姻狀況和口腔衛生狀況後，發現口腔衛生差者患慢性肺部感染及肺功能降低的幾率為口腔衛生良好者的1.77倍。
(5) 其他原因：國內和國外均有因牙病或拔牙後引發顱內膿腫的報導，口腔感染還可引起關節炎、眼虹膜睫狀體炎、腎病、某些皮膚病等。
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