人體中存在著免疫反應。人們發現口腔環境具有免疫反應能力，由於口腔內有多種細菌寄居於口腔軟、硬組織，或滲入到菌斑中形成廣泛潛在的免疫源。口腔記憶體在的各種免疫反應，其免疫成分是抗體和細胞。
牙周病時的免疫反應是以細胞免疫為主，同時有體液免疫參加。口腔組織中存在著的免疫反應具有兩重性，一方面可能起到保護作用；另一方面對病人也有破壞性，也就是致敏的淋巴細胞能夠產生淋巴因數，對牙周組織具有破壞性。也有人認為，患牙周病時有大量的漿細胞浸潤形成抗體，產生免疫反應.導致組織破壞，而細胞免疫反應僅僅起到加重炎症的作用。
因此，當全身免疫功能缺陷、發生紊亂時，即可出現牙周組織疾病。
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