齲齒發生的原因很複雜，就目前科學研究表明與多種因素有關，其中有三種主要因素。
（1）細菌細菌的存在是制病發生的主要條件，科學家們做過實驗說明:完全不接觸細菌的牙齒就不會發生齲齒，在人的口腔中存在著各種細菌，但不是所有的細菌都能引起龋齒，其中能夠產生酸的細菌如：變形鏈球菌，乳酸桿菌等，可以產酸，可使口腔中的局部環境的pH值（酸鹼度）降低至4.0-5.0，從而導致牙齒脫礦。這些細菌附著在牙面上形成菌斑。牙菌斑是一種稠密、不定形、非鈣化的團塊，牙菌斑在牙面上附著很緊，漱口、沖洗均不易除去，當用力刷牙清除後可在1〜6小時內重新形成。科學實驗證明，大多數情況下，細菌只有在形成了牙菌斑後才能致齲。這些細菌把食物中的糖分解發酵而產生酸，酸能將牙齒中的礦物質溶解岀來，逐漸腐蝕成一個洞，就是通常說的齲洞，齲洞就是在菌斑的基礎上發展起來的。
（2）食物食物的種類對齲齒的發生，有重要影響，蔗糖的致齲作用最顯著，蔗糖能加速口腔內變形鏈球菌的繁殖。食用高糖飲食如：奶糖、軟糖、甜點心等比低糖飲食更易使人患制。食用含纖維多的食物如蔬菜、瘦肉等對牙面有較大機械性摩擦和清洗作用，且不容易發酵產酸，在某種程度上有阻抑齲齒發生的作用。
（3）宿主這裏提出的宿主因素概念是指人體本身，特別是牙齒對齲病的敏感性或抗胡能力。
①牙齒的化學結構對齲病發生有重要影響，牙齒的礦化程度受遺傳、生活條件及機體代謝狀況的影響。
②牙齒排列擁擠、錯位、重疊，義齒卡環接觸處，接觸不良的套冠邊緣處，是菌斑集聚最多處，也是齲齒好發部位。
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