有導致齲齒的病菌，還有導致牙周病的病菌。另外還有疲勞時，導致在嘴角或牙齦上起水泡的病菌。而且這些細菌時刻存在我們的口腔裏。那麼，即使我們不可能做到像真空包裝一樣保證口腔裏完全無菌，至少也能防止細菌在人們的口腔裏殘留滋生。我們口腔內經常存在200種細菌。僅牙齒上的細菌就超過300種。
細菌以共同生存或者互相吞噬來維持一定的均衡。例如，細菌中有利用其他細菌的產物或新陳代謝的產物來繁殖或維持共生關係的；還有為了攻擊其他細菌製造出稱之為桿菌的蛋白質來守護自身優勢的。具有代表性的就是在牙齒表面棲息的細菌和在牙齦裏棲息的細菌。
在牙齒表面棲息的細菌，是腐蝕牙齒、誘發齲齒的齲齒菌，在牙齦裏棲息的細菌是誘發牙周病的牙周病菌。這些細菌在口腔健康時，以相互抑制其他細菌的繁殖來形成均衡。例如，如果糖分過多，那麼粘在牙齒表面的個齒菌通過攝取養分來擴張勢力。同時，牙齦菌相對地變弱，再也無法抵擋齲齒菌，結果出現了齲齒。相反，牙齦菌在沒有氧氣的牙齦深處或者在牙垢裏面棲息的過程中。因不認真刷牙導致牙垢越來越多，牙齦菌數量會增加，從而引起牙周病。事實上，齲齒嚴重的人牙周病菌比較少。
相反，因患牙周病而失掉牙齒的人的牙齒，很多時候乾淨得連一個齲洞也沒有。擊退這樣的細菌的方法大體有2種。一種是使用物理方法來消滅細菌，另一種是維持身體健康，提高對細菌的免疫力。
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