牙齒排列不整齊是牙頜畸形的一種表現,其病因大體分為遺傳因素、環境因素兩大方面。從廣義上而言，錯頜畸形是隨著人類的種族演化而發生、發展的，隨著直立行走的進程，軀體重心的改變,為適應頭部平衡,頜骨逐漸退化縮小。隨著火的使用，食物由硬到軟，咀嚼器官功能逐漸減弱,從而產生退化性縮小的遺傳性狀。而在咀嚼器官退化的過程中又存在著不平衡的現象，即肌肉居先、頜骨次之、牙齒再次，導致骨量、牙量的不協調，出現牙齒不齊。
具體至個體而言，牙頜錯亂也存在著發育上的遺傳趨勢，如父母雙方或單方有小下頜,其子女小下頜的可能性很大，這些個體都存在牙齒排列不齊或牙弓不平。此外，牙列不齊還受到個體生長發育過程中環境因素（包括先天因素與後天因素）的影響，如胎兒在母體內生存環境的變化和幼兒咬唇、咬物、吐舌等不良習慣都影響整齊牙列的形成。
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