不單是牙齒，上齶竇也會使人感到牙痛和頭痛。上齶竇是鼻子旁邊兩側骨骼裏的空地。偶爾上牙的齒根也會深入其中，平時感覺不到任何異常，但是如果患了膿腫或者由重感冒引發的炎症就會傳遞到牙齒根部，誘發疼痛。這時臉頰部分會覺得像被什麼東西充滿似的發悶。上齶竇疼痛時很難指出是從哪個牙齒開始的牙痛。如果這個部分的炎症消失，牙痛和頭痛也會一起消失，因此最好是通過正確的判斷來避免不必要的神經治療。
三叉神經痛也是沒有牙齒病變，但可以誘發與牙痛症狀相似的疼痛。所謂三叉神經痛也稱第五腦神經痛，是在三叉神經裏岀現的神經痛。三叉神經是感覺運動神經，負責臉部、口腔，鼻黏膜和舌的觸覺，也負責咀嚼時咀嚼肌的運動和下頜運動。因為很多部分都和口腔相關聯，所以出現三叉神經痛的時候，很容易誤會成牙痛。三叉神經痛最主要的原因是肌肉、韌帶或者在骨骼周邊，神經組織被壓迫，或者流向神經的血液不夠暢通。該病主要在40歲以後多發，疼痛從眼部周圍傳下來，蔓延到耳朵後面和臉頰的一邊，到嘴唇為止。疼痛非常嚴重：靜靜地待著也疼，洗臉、刮鬍子、吃東西、風掠過臉或者稍微碰一下，都會出現讓人揪心的像針紮一樣的刺痛。有時把它誤認為牙痛，即使進行不必要的拔牙或神經治療，疼痛還會持續。
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